Использование двух помп на один аквариум 200-250л в купе со стерилизатором полностью заменяет мощный канистровый фильтр. При этом всё оборудование легко обслуживается и ремонтопригодно. Первая помпа подключается, как говорилось выше к стерилизатору. Устанавливается вместе с губкой в «грязном» отсеке. Вода через губку и стерилизатор подается в «чистый отсек», т.е. выполняется как механическая и биологическая очистка, так и стерилизация. Биологическая очистка в данном случае выполняется с помощью полезных бактерий, живущих непосредственно в фильтрующем материале губки. Вторая помпа намного более мощная вместе с губкой также устанавливается в «грязном» отсеке, далее очищенная вода подается в «чистый» отсек. «Чистый» и «грязный» отсеки между собой напрямую не сообщаются. Вода циркулирует от «чистого» отсека в «рабочий» и далее в «грязный» проходя все необходимые стадии фильтрации.
Такой цикл позволяет всей грязи и мусору собираться только в грязном отсеке, что в свою очередь сокращает время на обслуживание аквариума.
Как правило, аквариумные помпы служат довольно долго и не страдают от перепада электрической мощности в сети и т.п. Разбирать и чистить помпу необходимо раз одну-две недели. В том случае, если вода жесткая, необходимо работающую помпу поместить в раствор лимонной кислоты на 1 час, затем промыть и поместить на место. Обычно проблема накипи (кальциевого налёта) на технологическом оборудовании решается именно так.